
- 2025-01-10 10:50:43藥物合成化學(xué)
- 藥物合成化學(xué)是化學(xué)與藥學(xué)交叉的學(xué)科,專注于藥物的合成路徑設(shè)計(jì)、反應(yīng)機(jī)理研究及工藝優(yōu)化。它利用有機(jī)化學(xué)、無機(jī)化學(xué)及生物化學(xué)的原理和方法,合成具有生物活性的化合物,即藥物分子。該領(lǐng)域旨在發(fā)現(xiàn)新藥、提高藥物產(chǎn)量、降低成本并優(yōu)化藥物性能,對(duì)醫(yī)藥行業(yè)的發(fā)展至關(guān)重要。通過合成化學(xué)手段,科學(xué)家能夠制備出用于治療各種疾病的藥物,為人類健康貢獻(xiàn)力量。
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藥物合成化學(xué)資訊
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藥物合成化學(xué)問答
- 2018-11-30 04:02:28聞韌藥物合成化學(xué)哪個(gè)版本好
- 聞韌藥物合成化學(xué)哪個(gè)版本好
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- 2023-02-14 11:23:01傳感器、發(fā)光材料、高壓拉曼、合成化學(xué)領(lǐng)域相關(guān)文獻(xiàn)推薦【學(xué)術(shù)簡訊23年3期】
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- 2023-04-10 15:50:43合成生物學(xué)握手AI,你想要的合成生物學(xué)
- 根據(jù)NCBI的ClinVar數(shù)據(jù)庫統(tǒng)計(jì),包括罕見疾病,如鐮狀細(xì)胞病、地中海貧血和先天性萊伯黑朦等超過3萬7千種已知疾病與致病性單核苷酸變異(SNV)有關(guān),SNV可能導(dǎo)致原始DNA序列、轉(zhuǎn)錄水平和蛋白質(zhì)序列等其他特性的變化。而新一代CRISPR/Cas9技術(shù)——堿基編輯器(BEs)可以有效地修復(fù)堿基突變,而不會(huì)誘導(dǎo)雙鏈DNA斷裂,從而能夠直接、不可逆地校正堿基突變,對(duì)于治愈SNV引起的遺傳疾病具有十分廣闊的前景。已經(jīng)報(bào)道的有誘導(dǎo)C·G到T·A轉(zhuǎn)化的胞嘧啶堿基編輯器(CBE)、誘導(dǎo)A·T到G·C轉(zhuǎn)化的腺嘌呤堿基編輯器(ABE)和使C·G到G·C轉(zhuǎn)換的糖基化酶堿基編輯器(GBE),這些BEs為治 療50%以上致病性SNV提供了幾乎理想的解決方案。然而,在實(shí)施基于BE的基因療法之前,有必要大量構(gòu)建具有致病性SNV的細(xì)胞疾病模型,以用于開發(fā)和優(yōu)化BEs,并使其在基因治 療中的應(yīng)用成為可能。同時(shí),根據(jù)ClinVar的數(shù)據(jù),大約50%的人類致病性SNV是C·G到T·A的轉(zhuǎn)化,然而目前很難通過合理的人力和資金投入獲得大量攜帶這些SNV的細(xì)胞模型。這一方面是由于大規(guī)模樣品,手動(dòng)操作不僅耗時(shí),而且容易出錯(cuò),一致性較差且成本高昂;另外一方面,現(xiàn)有的基于目標(biāo)-位點(diǎn)集成庫的方法,如Be-Hive等在為AI學(xué)習(xí)和預(yù)測編輯性能的數(shù)據(jù)時(shí),缺乏原位信息的綜合編輯位點(diǎn)數(shù)據(jù),同時(shí)又缺少真實(shí)染色體環(huán)境(先前研究表明,核酸酶的性能與染色質(zhì)可及性之間存在很強(qiáng)的相關(guān)性,并且基因編輯在真核染色質(zhì)中比異染色質(zhì)中更有效)。中科院天津工業(yè)生物技術(shù)研究所和天津科技大學(xué)的團(tuán)隊(duì),開發(fā)了一個(gè)由以下四個(gè)模塊組成的用于哺乳動(dòng)物細(xì)胞高通量原位基因編輯的自動(dòng)化平臺(tái),實(shí)現(xiàn)了哺乳動(dòng)物細(xì)胞基因編輯的標(biāo)準(zhǔn)化和可拓展性。(1)內(nèi)源性靶g(shù)RNA計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì);(2)gRNA表達(dá)質(zhì)粒構(gòu)建;(3)哺乳動(dòng)物細(xì)胞堿基編輯;(4)CBEs性能模型構(gòu)建的機(jī)器學(xué)習(xí)。四個(gè)模塊組成的用于哺乳動(dòng)物細(xì)胞高通量原位基因編輯的自動(dòng)化平臺(tái),實(shí)現(xiàn)了哺乳動(dòng)物細(xì)胞基因編輯的標(biāo)準(zhǔn)化和可拓展性。該平臺(tái)借助大規(guī)模的原位編輯數(shù)據(jù)和序列信息,結(jié)合局部染色質(zhì)可及性,具有原位數(shù)據(jù)的機(jī)器學(xué)習(xí)模型能夠更好地預(yù)測實(shí)際的堿基編輯效率,使獲得內(nèi)生目標(biāo)的大規(guī)模編輯數(shù)據(jù)集成為可能。圖1 全自動(dòng)高通量哺乳動(dòng)物基因編輯平臺(tái)概覽在這四個(gè)模塊中,第 一個(gè)模塊用于負(fù)責(zé)gRNA設(shè)計(jì),以將人類致病性SNV引入野生型細(xì)胞,作者使用生物信息學(xué)分析選擇了1210個(gè)基因作為靶位點(diǎn),使用包含每個(gè)靶位點(diǎn)上游3 bp至下游750 bp靶區(qū)的DNA序列,分批處理用于分析編輯結(jié)果的三對(duì)引物。對(duì)于自動(dòng)化gRNA質(zhì)粒構(gòu)建工作流程模塊,gRNAs質(zhì)粒構(gòu)建過程中采用了貝克曼庫爾特Echo納升級(jí)聲波移液系統(tǒng)用于操縱DNA組裝反應(yīng),相對(duì)于標(biāo)準(zhǔn)的Golden Gate DNA組裝方法的反應(yīng)體積為15μl,Echo的納升級(jí)和無吸頭操作能夠?qū)?shí)驗(yàn)步驟進(jìn)行一系列優(yōu)化,將反應(yīng)系統(tǒng)最小化到1微升的總體積,從而顯著降低了實(shí)驗(yàn)成本。隨后使用貝克曼庫爾特Biomek i7自動(dòng)化移液工作站將DH5α感受態(tài)細(xì)胞與Golden Gate產(chǎn)物進(jìn)行混合,通過ClonePix進(jìn)行轉(zhuǎn)化鋪板,并在通過DNA測序驗(yàn)證構(gòu)建質(zhì)粒之后,使用Biomek i7進(jìn)行質(zhì)粒提取。為了分析數(shù)據(jù)編輯結(jié)果,使用Python腳本讀取sanger測序文件,比較N20,并創(chuàng)建兩個(gè)參考csv文件。錯(cuò)誤的組裝csv文件包括一個(gè)選擇列表,用于從48孔細(xì)菌菌落板到96孔深孔板中挑選新菌落,以便ClonePix進(jìn)行另一輪驗(yàn)證。正確組裝csv文件包含N20測序及其在96孔深孔板中的位置,用于使用貝克曼庫爾特Biomek i7自動(dòng)化移液工作站進(jìn)行質(zhì)粒提取。此模塊高通量自動(dòng)化系統(tǒng)在4天之內(nèi)共構(gòu)建和分析了1210個(gè)gRNA質(zhì)粒,成功率達(dá)99%,實(shí)現(xiàn)了每天384個(gè)gRNA組裝的通量。而后續(xù)使用Biomek i7進(jìn)行的質(zhì)粒提取,通量則可達(dá)到576個(gè)質(zhì)粒/天。圖2 全自動(dòng)gRNA質(zhì)粒構(gòu)建工作流程概述示意圖第三個(gè)模塊是哺乳動(dòng)物細(xì)胞中的堿基編輯,如圖3。通過優(yōu)化實(shí)驗(yàn)條件,作者開發(fā)了使用Biomek i7自動(dòng)化移液工作站進(jìn)行包括細(xì)胞接種和轉(zhuǎn)染、細(xì)胞培養(yǎng)基更換以及進(jìn)行樣品收集在內(nèi)的編輯過程。隨后進(jìn)行靶區(qū)域的細(xì)胞裂解和PCR擴(kuò)增。全自動(dòng)高通量系統(tǒng)在6h內(nèi)將1210組gRNA和BE4max質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染到HEK293T細(xì)胞中,并在2 h內(nèi)完成后續(xù)培養(yǎng)基更換。培養(yǎng)5天后,收獲編輯的細(xì)胞于8小時(shí)內(nèi)完成進(jìn)行PCR分析,然后進(jìn)行sanger測序。使用Python腳本產(chǎn)生3個(gè)csv文件,一個(gè)用于準(zhǔn)備新一輪PCR的挑選列表,以分析使用Biomek i7從96孔裂解樣品板到96孔PCR板的false sample;第二個(gè)csv文件包含用于分析false sample的第二個(gè)引物對(duì)的序列和位置信息,用于新一輪PCR;第三個(gè)csv文件包含正確的樣本和編輯效率結(jié)果,用于下一步的AI學(xué)習(xí)。圖3 自動(dòng)化基因編輯過程的工作流程概述第四個(gè)模塊為作者開發(fā)的AI模型——染色質(zhì)可及性學(xué)習(xí)模型(CAELM),預(yù)測基礎(chǔ)編輯的結(jié)果。CAELM基于自動(dòng)化平臺(tái)生成的高度均勻的原位基因組編輯數(shù)據(jù),預(yù)測HEK4T細(xì)胞中的BE293max行為,并實(shí)現(xiàn)了0.64的皮爾遜相關(guān)值。皮爾遜r是評(píng)估數(shù)值數(shù)據(jù)模型準(zhǔn)確性的最普遍指標(biāo)之一,CAELM模型中考慮了目標(biāo)序列的真實(shí)染色體環(huán)境,這提供了更好、更現(xiàn)實(shí)的預(yù)測;同時(shí),CAELM還提供了模型輸入的特征重要性得分,并揭示了DNA可及性相對(duì)于目標(biāo)序列上下文的貢獻(xiàn)在預(yù)測中接近1:6。通過與32個(gè)不同基因組位點(diǎn)的手動(dòng)操作進(jìn)行比較,其中16個(gè)目標(biāo)位點(diǎn)在兩個(gè)操作過程中的編輯效率幾乎相等,而自動(dòng)化高通量系統(tǒng)在其他14個(gè)位點(diǎn)的統(tǒng)計(jì)分析中表現(xiàn)出更高的編輯效率。這些結(jié)果表明,自動(dòng)化高通量系統(tǒng)能夠以與手動(dòng)操作相當(dāng)?shù)男蕡?zhí)行基礎(chǔ)編輯;隨機(jī)選擇BE4max編輯靶標(biāo)的1210個(gè)與疾病相關(guān)的SNV的編輯效率均達(dá)到了較高水平,說明可以同時(shí)有效地操縱數(shù)千個(gè)內(nèi)源性靶位點(diǎn)的人類細(xì)胞的全自動(dòng)高通量原位基因編輯平臺(tái)的成功建立。
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- 2023-01-09 17:25:54精彩回放 | 藥物自由水、結(jié)晶水含量測定和藥物引濕性
- 您了解如何分析藥物樣品中是否含有水/溶劑嗎?怎樣精確量化自由水、結(jié)晶水含量?如何正確評(píng)估藥物的吸濕性和相轉(zhuǎn)變?在實(shí)際操作中我們會(huì)通過乳糖實(shí)例來具體分析無定形材料,此外還有水合物的形成及包材評(píng)估等知識(shí)點(diǎn)。藥物水含量測定SA實(shí)驗(yàn)程序設(shè)計(jì)選擇等溫吸附模型 精彩片段
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- 2022-12-31 11:08:41藥物分析中的高效液相色譜
- 在高效液相色譜應(yīng)用的初期,人們認(rèn)為它會(huì)成為氣相色譜的補(bǔ)充方法,然而今天HPLC在藥物分析中幾乎完全取代了氣相色譜。與其他方法相比,在色譜過程中可能會(huì)改變流動(dòng)極性的液體流動(dòng)相的應(yīng)用以及根據(jù)所測試物質(zhì)的特性對(duì)流動(dòng)相進(jìn)行的所有其他修改,在分離過程中具有很大的優(yōu)勢。 任何藥物的高效液相色譜 (HPLC) 分析的目的是確認(rèn)藥物的特性并提供定量結(jié)果。還可以用于通過藥物注冊(cè)前調(diào)查期間的生物醫(yī)學(xué)和治療研究,進(jìn)一步了解人體的正常和疾病過程。生物體液(尤其是血漿、血清或尿液)中藥物和代謝物的分析是高效液相色譜最苛刻但最常見的用途之一。血液、血漿或血清含有十種濃度遠(yuǎn)高于分析物濃度的大量內(nèi)源性化合物。分析物濃度通常很低,對(duì)于藥物而言,內(nèi)源性化合物有時(shí)在結(jié)構(gòu)上與待測藥物非常相似。藥物與血漿蛋白的結(jié)合也可能發(fā)生,這會(huì)減少所測量的游離化合物的量。 液相色譜技術(shù)對(duì)于研究小分子和大分子之間的相互作用非常方便,特別是研究藥物-蛋白質(zhì)結(jié)合。部分研發(fā)人員已經(jīng)使用固定化人血清白蛋白相來研究苯二氮卓類藥物、華法林、布洛芬等藥物的相互作用。使用這個(gè)階段作為體內(nèi)發(fā)生的相互作用的模型可以更進(jìn)一步。通過在流動(dòng)相中添加藥物,可以研究一種藥物與人血清白蛋白的相互作用如何受到另一種藥物的影響。 液相色譜還廣泛用于對(duì)藥物制劑進(jìn)行的藥物溶出度研究,以評(píng)估進(jìn)入胃時(shí)制劑中藥物物質(zhì)的可用性。將制劑攪拌,溶解浴通常含有旨在模擬胃中條件的水性緩沖液,然后在設(shè)定的時(shí)間段內(nèi)對(duì)水性緩沖液取樣并分析藥物濃度。藥物穩(wěn)定性研究至關(guān)重要,因?yàn)樾枰苊鉂撛诘挠卸窘到猱a(chǎn)物。在此類研究中,有必要證明制劑的藥物含量沒有隨時(shí)間變化。此外,如果確實(shí)發(fā)生降解,則有必要識(shí)別和量化降解產(chǎn)物?,F(xiàn)階段在很多國家的藥典中都是使用高效液相色譜法代替化學(xué)和許多儀器方法來控制藥物。 深圳市恒譜生科學(xué)儀器有限公司是致力于高品質(zhì)色譜耗材配件的研發(fā)制造OEM為一體的生產(chǎn)企業(yè),專業(yè)研發(fā)色譜柱、空柱管總成、保護(hù)柱、在線過濾器、篩板、溶劑過濾器、管路接頭等。 我們不斷地提高研發(fā)制備能力、優(yōu)化管理體系,以嚴(yán)苛的制程管控、優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品服務(wù),為各色譜儀器廠家和耗材供應(yīng)商提供更優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品及更有力的服務(wù)支持,與大家攜手共創(chuàng)美好未來! 今天恒譜生分享的知識(shí)先到這啦,希望對(duì)您的工作有所幫助!
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