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    FuniCut? Esp3I(BsmBI)限制性內(nèi)切酶(Esp3I(BsmBI)酶切序列位點CGTCTC(N)1/)

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    詳細介紹

    酶切點位

    5'-CGTCTC(N)1-3'

    3'-GCAGAG(N)5-5'

     

    產(chǎn)品描述

    FuniCut™系列內(nèi)切酶是通過基因工程重組技術,可在5~15 min內(nèi)精確完成DNA切割的快速限制性內(nèi)切酶,適用于快速切割質(zhì)粒DNA、PCR產(chǎn)物、基因組DNA等。FuniCut™系列快速內(nèi)切酶共用一種酶切緩沖液,從而簡化了酶切反應體系,另外,有良好的酶活冗余度,可輕松處理底物過量或困難模板的酶切。

     

    產(chǎn)品組分

    組分編號

    組分名稱

    產(chǎn)品規(guī)格

    15048-A

    FuniCut™ Esp3I (BsmBI)

    30 μL

    15048-B

    10×FuniCut™ Buffer

    1 mL

    15048-C

    10×FuniCut™ Color Buffer

    1 mL

     

    運輸與保存方法

    冰袋運輸。-20°C保存,有效期2年。

     

    識別位置

    5'-CGTCTC(N)1-3'

    3'-GCAGAG(N)5-5'

     

    推薦反應條件

    1× FuniCut™緩沖液;

    37°C孵育。

     

    失活條件

    80°C孵育20 min。

     

    注意事項

    1)3 h孵育未表現(xiàn)星號活性,延時酶切可能出現(xiàn)星號活性;

    2)受CpG甲基化影響,序列完全重疊,剪切受阻;

    3)受EcoBI甲基化影響,序列可能重疊,剪切可能受影響

    3)為了您的安全和健康,請穿實驗服并佩戴一次性手套操作;

    4)本產(chǎn)品僅作科研用途!

     

    質(zhì)量控制 

    1.功能活性檢測:最適反應溫度下,在20 μL反應體系中,1 μL酶能夠在15 min內(nèi)完全消化1 μg λDNA。

    2.超長時間孵育檢測:最適反應溫度下,將1 μL酶與1 μg λDNA共孵育3 h,未檢測到其他核酸酶污染或星號活性引起的底物非特異性降解,但延長孵育時間可能出現(xiàn)星號活性。

    3.酶切-連接-再酶切檢測:最適反應溫度下,使用1 μL酶消化底物,回收酶切產(chǎn)物,在22°C下使用適量T4 DNA連接酶可以將酶切產(chǎn)物重新連接,將連接產(chǎn)物再次回收后,使用相同的內(nèi)切酶可以重新切開連接產(chǎn)物。

    4.DNase殘留檢測:1 μL FuniCut™ Esp3I與雙鏈DNA底物在37℃溫育16 h,通過DNA電泳檢測雙鏈DNA底物無變化。

     

    使用方法

    1. DNA快速酶切流程

    1)按如下建議的加樣順序配制體系反應液(冰上操作):

    組分

    質(zhì)粒DNA

    PCR產(chǎn)物

    基因組DNA

    ddH2O

    15 μL

    16 μL

    30 μL

    10×FuniCut™ Buffer或10×FuniCut™ Color Buffer

    2 μL

    3 μL*

    5 μL

    底物DNA

    2 μL(~1 μg)

    10 μL (~0.2 μg)

    10 μL (5 μg)

    FuniCut™ Esp3I (BsmBI)

    1 μL

    1 μL

    5 μL

    Total

    20 μL

    30 μL

    50 μL

    *本體系指已純化后的PCR產(chǎn)物。未純化的PCR產(chǎn)物具備一定的離子強度,10×FuniCut TM Buffer加入量可適當減少至2 μL。若下一步進行克隆等實驗,酶切前需純化PCR產(chǎn)物。

    2)輕柔吸打或輕彈管壁以混勻(切勿渦旋),然后瞬時離心以收集掛壁液滴。

    3)37°C孵育15 min(質(zhì)粒),或15~30 min(PCR 產(chǎn)物),或30~60 min(基因組 DNA)。

    4)80℃溫育 20 min 即可使酶失活,停止反應(可選)。

    2. 雙酶切或多酶切

    1)每種內(nèi)切酶的用量為1 μL,并根據(jù)需要適當擴大反應體系。

    2)所有內(nèi)切酶的體積總和不得超過總反應體系的1/10。

    3)如果選用的幾種內(nèi)切酶的最適反應溫度不同,應先以最適溫度低的酶開始酶切,再添加最適溫度較高的酶,以較高的溫度進行孵育。

    3.質(zhì)粒的擴大反應體系

    組分

    體積(20 μL

    體積(20 μL

    體積(50 μL

    DNA

    1 μg

    2 μg

    5 μg

    FuniCut™ Esp3I

    1 μL

    2 μL

    5 μL

    10×FuniCut™ Buffer或10×FuniCut™ Color Buffer

    2 μL

    2 μL

    5 μL

    Total

    20 μL

    20 μL

    50 μL

    :如果總反應體系大于20 μL,可使用水浴、金屬浴或沙浴,并增加孵育時間。

     

    不同DNA中的識別位點數(shù)

    λDNA

    ΦX174

    pBR322

    pUC57

    pUC18/19

    SV40

    M13mp18/19

    Adeno2

    14

    0

    1

    2

    2

    0

    1

    21

     

    甲基化修飾影響

    Dam

    Dcm

    CpG

    EcoKI

    EcoBI

    無影響

    無影響

    序列完全重疊

    剪切阻斷

    無影響

    序列可能重疊

    剪切可能受影響

     

    不同反應緩沖液中的活性

    反應緩沖液

    FuniCut™

    Buffer

    Thermo Scientific

    FastDigest Buffer

    NEB

    CutSmart® Buffer

    Takara

    QuickCut™ Buffer

    活性

    100%

    100%

    100%

    100%

    :活性數(shù)據(jù)來自翌圣生物限制酶標準反應體系下的檢測。

     

    同裂酶

    BsmBI, BstGZ53I, Esp16I, Esp23I

    :同裂酶對于不同的甲基化修飾也許具有不同敏感性。

    keywords: Esp3I、Esp3 I、Esp3 i、Esp31、Esp3 1、Esp3Ⅰ、Esp3 Ⅰ、Esp3

     

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