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    Hieff NGS? Ultima Pro DNA Library Prep Kit 全能型DNA建庫試劑盒

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    詳細(xì)介紹

    Hieff NGS® Ultima Pro DNA Library Prep Kit是針對(duì)Illumina®MGI®高通量測序平臺(tái)專業(yè)開發(fā)設(shè)計(jì)的新一代建庫試劑盒。本產(chǎn)品采用高質(zhì)量的酶學(xué)組成,在前一代建庫試劑盒的基礎(chǔ)上,改進(jìn)了DNA片段末端修復(fù)和加A效率,同時(shí)改善接頭連接效率。本試劑盒采用新型的高保真酶,顯著提高擴(kuò)增均一性和保真性,可應(yīng)用于常規(guī)動(dòng)植物基因組、微生物基因組、FFPEcfDNA、ChIP DNA等樣本,助力獲得優(yōu)異的測序數(shù)據(jù)。

    產(chǎn)品組分

    運(yùn)輸與保存方法

    冰袋運(yùn)輸。所有組分-20 °C保存,有效期1年。

     

    注意事項(xiàng)

    一、關(guān)于操作

    1. 為了您的安全和健康,請穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。

    2. 請于使用前將試劑盒各組分置于室溫解凍。解凍后上下顛倒數(shù)次充分混勻,短暫離心后置于冰上待用。

    3. 配制各步驟反應(yīng)液時(shí)推薦使用移液器吹打混勻或輕輕振蕩,劇烈振蕩可能會(huì)造成文庫產(chǎn)出下降。

    4. 為避免樣品交叉污染,推薦使用帶濾芯的槍頭,吸取不同樣品時(shí)請更換槍頭。

    5. 推薦在帶熱蓋的PCR儀中進(jìn)行各步驟反應(yīng),使用前應(yīng)預(yù)熱PCR儀至反應(yīng)溫度附近。

    6. PCR產(chǎn)物因操作不當(dāng)極容易產(chǎn)生氣溶膠污染,進(jìn)而影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確性。推薦將PCR反應(yīng)體系配制區(qū)和PCR產(chǎn)物純化檢測區(qū)進(jìn)行強(qiáng)制性的物理隔離;使用專用的移液器等設(shè)備;并定時(shí)對(duì)各實(shí)驗(yàn)區(qū)域進(jìn)行清潔(使用0.5%次氯酸鈉或10%漂白劑進(jìn)行擦拭清理),以保證實(shí)驗(yàn)環(huán)境的潔凈度。

    7. 本產(chǎn)品僅作科研用途!

     

    二、關(guān)于DNA片段化

    1. 本試劑盒中兼容機(jī)械法及酶切法片段化的DNA。

    2. 本試劑盒兼容范圍為100 pg - 1000 ng Input DNA。應(yīng)盡可能使用A260/A280 = 1.8-2.0的高質(zhì)量Input DNA。表1中列舉了將本試劑盒應(yīng)用于常見應(yīng)用中推薦的Input DNA量。

    1  常見應(yīng)用中推薦Input DNA

    應(yīng)用

    樣本類型

    推薦Input DNA

    全基因組測序

    復(fù)雜基因組

    50 ng-1000 ng

    靶向捕獲測序

    復(fù)雜基因組

    10 ng-1000 ng

    全基因組測序,靶向捕獲測序

    FFPE DNA

    50 ng-1000 ng

    全基因組測序,靶向捕獲測序

    cfDNA/ctDNA

    ≥500 pg

    全基因組測序

    微生物基因組

    ≥1 ng

    全基因組測序PCR-free測序

    高質(zhì)量DNA

    ≥50 ng

    【注】:上表為使用高質(zhì)量DNA時(shí)推薦的Input DNA量,當(dāng)Input DNA質(zhì)量較差或需要進(jìn)行片段分選時(shí),應(yīng)適當(dāng)上調(diào)使用量。

    3. Input DNA特指投入末端修復(fù)/dA尾添加步驟中的DNA。

    4. Input DNA制備過程中帶入的高濃度金屬離子螯合劑或其他鹽,可能會(huì)影響末端修復(fù)/dA尾添加步驟反應(yīng)效率,建議DNA片段化后進(jìn)行磁珠純化或分選。當(dāng)使用機(jī)械法進(jìn)行DNA片段化且產(chǎn)物不進(jìn)行純化或長度分選而直接建庫時(shí),請將DNA稀釋在TE Buffer中進(jìn)行片段化,請勿在滅菌超純水中進(jìn)行。

     

    三、關(guān)于接頭連接(Adapter Ligation)

    1. 針對(duì)Illumina®測序平臺(tái),Yeasen提供Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 1~Set 2 (Cat#13519~Cat#13520),試劑盒中的接頭濃度為15 μM;Hieff NGS® 384 CDI Primer for Illumina®(Cat#12412~Cat#12413)試劑盒中的接頭濃度為

    15 μM;Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina® (Cat#12404~Cat#12407),試劑盒中的接頭濃度為15 μM;Hieff NGS® Dual UMI UDI Adapter Kit for Illumina®,Set1~Set2 Cat#13370~Cat#13371),試劑盒中的接頭濃度為15 μM。

    2.針對(duì)MGI® 高通量測序平臺(tái),Yeasen提供了Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI®,Set 1~Set 3Cat#13360 ~ Cat#13362,試劑盒中的接頭濃度為10 μM;Hieff NGS® 384 CDI Primer for MGI®Set 1~Set 2Cat#13363 ~ Cat#13364,試劑盒中的接頭濃度為10 μM;也可搭配Hieff NGS® Dual UMI UDB Adapter Kit for MGI®,Set 1~Set 2 (Cat#13367~Cat#13368)雙端UMI UDB短接頭,試劑盒中的接頭濃度為10 μM。

    3. Adapter的質(zhì)量和使用濃度直接影響連接效率及文庫產(chǎn)量。Adapter用量過高可能會(huì)產(chǎn)生較多Adapter Dimer;用量較低可能會(huì)影響連接效率及文庫產(chǎn)量;使用Adapter時(shí)根據(jù)Input DNA量用TE Buffer進(jìn)行相應(yīng)稀釋 

    2列舉了使用本試劑盒不同Input DNA量推薦的針對(duì)Illumina®測序平臺(tái)Adapter稀釋方法。

    3列舉了使用本試劑盒不同Input DNA量推薦的針對(duì)MGI®測序平臺(tái)Adapter稀釋方法。

    4列舉了使用本公司Hieff NGS® Dual UMI UDB Adapter Kit for MGI®Set 1~Set 2 (Cat#13367~Cat#13368)不同Input DNA量推薦的UMI Adapter稀釋方法。

    2  100 pg-1 μg Input DNA針對(duì)Illumina®測序平臺(tái)推薦的Adapter使用濃度

    Input DNA

    Adapter稀釋倍數(shù)

    濃度

    0.1ng ~ 1 ng

    150倍稀釋

    0.1 μM

    1 ng ~ 10 ng

    75倍稀釋

    0.2 μM

    10 ng ~ 25 ng

    15倍稀釋

    1 μM

    25 ng ~ 100 ng

    7.5倍稀釋

    2 μM

    100 ng ~ 1000 ng

    3倍稀釋

    5 μM

    3  100 pg-1ug Input DNA針對(duì)MGI®測序平臺(tái)推薦的Adapter使用濃度

    Input DNA

    Adapter稀釋倍數(shù)

    濃度

    <1 ng

    100倍稀釋

    0.1 μM

    1 ng ~ 10 ng

    50倍稀釋

    0.2 μM

    10 ng ~ 25 ng

    10倍稀釋

    1 μM

    25 ng ~ 100 ng

    5倍稀釋

    2 μM

    100 ng ~ 1000 ng

    2倍稀釋

    5 μM

    4  100 pg-1ug Input DNA針對(duì)MGI®測序平臺(tái)推薦的UMI Adapter使用濃度

    Input DNA

    Adapter稀釋倍數(shù)

    濃度

    5 ng ~ 25 ng

    50倍稀釋

    0.2 μM

    25 ng ~ 100 ng

    10倍稀釋

    1 μM

    100 ng ~ 1000 ng

    4倍稀釋

    2.5 μM

     

    四、關(guān)于磁珠純化與分選 (Bead-based Clean Up and Size Selection)

    1. DNA片段長度分選步驟可選擇在末端修復(fù)/dA尾添加之前,或接頭連接后,或文庫擴(kuò)增后進(jìn)行。

    2. 當(dāng)Input DNA質(zhì)量≥50 ng,您可選擇在接頭連接后分選;如Input DNA質(zhì)量<50 ng,建議您在文庫擴(kuò)增后進(jìn)行分選。

    3. Ligation Enhancer中包含高濃度的PEG,會(huì)對(duì)雙輪磁珠分選產(chǎn)生顯著影響。因此,如在接頭連接后進(jìn)行長度分選,必須先進(jìn)行純化步驟,再進(jìn)行雙輪分選步驟;如在末端修復(fù)/dA尾添加之前或文庫擴(kuò)增后進(jìn)行長度分選,可直接進(jìn)行雙輪磁珠分選步驟。

    4. 磁珠使用前應(yīng)先平衡至室溫,否則會(huì)導(dǎo)致得率下降、分選效果不佳。

    5. 磁珠每次使用前都應(yīng)充分振蕩混勻或使用移液器上下吹打充分混勻。

    6. 轉(zhuǎn)移上清時(shí),請勿吸取磁珠,即使微量殘留都將影響后續(xù)文庫質(zhì)量。

    7. 磁珠漂洗使用的80%乙醇應(yīng)現(xiàn)用現(xiàn)配,否則將影響回收效率。

    8. 進(jìn)行長度分選時(shí),初始樣品體積應(yīng)盡量≥100 μL,不足時(shí)請用超純水補(bǔ)齊。以防因樣品體積太小導(dǎo)致移液誤差增大。

    9. 產(chǎn)物洗脫前應(yīng)將磁珠置于室溫干燥。干燥不充分容易造成無水乙醇?xì)埩粲绊懞罄m(xù)反應(yīng);過分干燥又會(huì)導(dǎo)致磁珠開裂進(jìn)而降低純化得率。通常情況下,室溫干燥3-5 min足以讓磁珠充分干燥。

    10. DNA純化或長度分選產(chǎn)物如需保存,可使用TE Buffer洗脫,產(chǎn)物可于4 °C可保存1-2周,-20 °C可保存1個(gè)月。

     

    五、關(guān)于文庫擴(kuò)增 (Library Amplification)

    1. 是否需要進(jìn)行文庫擴(kuò)增取決于Input DNA量、Adapter是否為完整長度、應(yīng)用需要等因素。如使用非完整長度Adapter,必須進(jìn)行這一步驟。如使用完整長度Adapter,當(dāng)Input DNA<200 ng時(shí),推薦進(jìn)行文庫擴(kuò)增;當(dāng)Input DNA≥200 ng或者不需要進(jìn)行文庫擴(kuò)增時(shí),可不進(jìn)行文庫擴(kuò)增。

    2. 文庫擴(kuò)增步驟需要嚴(yán)格控制擴(kuò)增循環(huán)數(shù)。循環(huán)數(shù)不足,將導(dǎo)致文庫產(chǎn)量低;循環(huán)數(shù)過多,又將導(dǎo)致文庫偏好性增加、重復(fù)度增加、嵌合產(chǎn)物增加、擴(kuò)增突變積累等多種不良后果。表5列舉了使用本試劑盒,獲得1 μg文庫的推薦循環(huán)數(shù)。

    5  100 pg-1000 ng Input DNA獲得1 μg產(chǎn)物擴(kuò)增循環(huán)數(shù)推薦表

    Input DNA

    1 μg文庫產(chǎn)量推薦PCR循環(huán)數(shù)

    1000 ng

    2 - 4

    500 ng

    2 - 4

    250 ng

    4 - 6

    100 ng

    5 - 7

    50 ng

    7 - 9

    10 ng

    9 - 11

    5 ng

    10 - 12

    1 ng

    12 - 15

    100 pg

    16 - 18

    【注】:

    1.表5為使用200 bp左右的高質(zhì)量Input DNA測試的循環(huán)數(shù)參數(shù)。FFPE DNA質(zhì)量差異較大,當(dāng)DNA質(zhì)量較差或文庫長度較長時(shí),需適當(dāng)提高循環(huán)數(shù)以獲取足量文庫。

    2.如果建庫過程中需要進(jìn)行過片段分選,推薦較高循環(huán)數(shù)進(jìn)行Library Amplification反之則參照較低循環(huán)數(shù)即可。

    3.如果使用了不完整的接頭,需要擴(kuò)增至少2個(gè)循環(huán),形成完整的接頭。

     

    六、關(guān)文庫質(zhì)檢 (Library Quality Analysis)

    1. 通常情況下,構(gòu)建好的文庫可通過長度分布檢測和濃度檢測來進(jìn)行質(zhì)量評(píng)價(jià)。

    2. 文庫濃度檢測可使用:基于雙鏈DNA熒光染料的方法,如Qubit®、PicoGreen®等;基于qPCR絕對(duì)定量的方法。

    3. 文庫濃度檢測不可使用:基于光譜檢測的方法,如NanoDrop®等。

    4. 推薦使用qPCR方法進(jìn)行文庫濃度檢測:Qubit®、PicoGreen®等基于雙鏈DNA熒光染料的濃度測定方法時(shí),無法有效區(qū)分單端連接Adapter的產(chǎn)物、兩端均未連接Adapter的產(chǎn)物以及其他不完整雙鏈結(jié)構(gòu)產(chǎn)物;qPCR絕對(duì)定量基于PCR擴(kuò)增原理,僅定量樣品中兩端Adapter完整的文庫(即可測序的文庫),可排除單端或雙端都不連接Adapter的不可測序文庫的干擾。

    5. 文庫長度分布檢測,可通過Agilent Bioanalyzer 2100等基于毛細(xì)管電泳或微控流原理的設(shè)備進(jìn)行檢測。

     

    使用方法

    一、自備材料

    1. 純化磁珠:Cat#12601Hieff NGS® DNA Selection BeadsCat#A63880,AMPure XP Beads或其他等效產(chǎn)品。

    2. DNA質(zhì)控:Agilent Technologies 2100 Bioanalyzer或其他等效產(chǎn)品。

    3. DNA Adapter:可選Yeasen 官網(wǎng)Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 1~Set 2 (Cat#13519~Cat#13520);雙端384CDI PrimersHieff NGS® 384 CDI Primer for Illumina®, Set 1~Set 2 (Cat#12412~Cat#12413);雙端384UDI PrimersHieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina® (Cat#12404~Cat#12407)Hieff NGS® Dual UMI UDI Adapter Kit for Illumina®,Set1~Set2 Cat#13370~Cat#13371DNA 文庫構(gòu)建專用配套試劑盒,

    或者可選匹配MGI平臺(tái)的接頭:Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI®,Set 1~Set 3Cat#13360 ~ Cat#13362Hieff NGS® 384 CDI Primer for MGI®,Set 1~Set 2Cat#13363 ~ Cat#13364Hieff NGS® Dual UMI UDB Adapter Kit for MGI®,Set 1~Set 2 (Cat#13367~Cat#13368);接頭詳細(xì)介紹信息參考上面注意事項(xiàng)中的第三部分關(guān)于接頭連接

    4.DNA Primer MixCat#12190,DNA Library Prep Primer Mix for Illumina® Cat#12191,DNA Library Prep Primer Mix for MGI®

    5. 其他材料:無水乙醇、滅菌超純水、TE Buffer (10 mM Tris-HClpH 8.0-8.5+1 mM EDTA)、低吸附EP管、PCR管、磁力架、PCR儀等。


    二、操作流程

    1  Hieff NGS® Ultima Pro DNA Library Prep Kit for Illumina操作流程

     

    三、操作步驟

    3.1 末端修復(fù)/dA尾添加 (End Repair/dA-Taling)

    該步驟將片段化后的Input DNA末端補(bǔ)平,并進(jìn)行5’端磷酸化和3’端加dA尾。

    1. 將表6中各試劑解凍后,顛倒混勻,置于冰上備用。

    2. 于無菌PCR管中配制表6所示反應(yīng)體系。

    6  末端修復(fù)/dA尾添加PCR反應(yīng)體系

    名稱

    體積 (μL)

    Fragmented DNA

    x

    Endprep Buffer 2.0

    6

    Endprep Enzyme 2.0

    4

    ddH2O

    Up to 60

    3. 使用移液器輕輕吹打或振蕩混勻,并短暫離心將反應(yīng)液離心至管底。

    4. 將上述PCR管置于PCR儀,設(shè)置表7所示反應(yīng)程序,進(jìn)行末端修復(fù)/dA尾添加反應(yīng)。

    7  末端修復(fù)/dA尾添加PCR反應(yīng)程序

    溫度

    時(shí)間

    熱蓋105 °C

    On

    30 °C

    20 min

    72 °C

    20 min

    4 °C

    Hold

     

    3.2 接頭連接 (Adapter Ligation)

    該步驟將3.1步驟的產(chǎn)物末端,連接特定的Illumina®接頭。

    1. 根據(jù)Input DNA量按表2-4稀釋Adapter至合適濃度。

    2. 將表8中各試劑解凍后顛倒混勻,置于冰上備用。

    3. 3.1步驟PCR管中配制表8所示反應(yīng)體系。

    8  Adapter Ligation PCR體系

    名稱

    體積 (μL)

    dA-tailed DNA3.1步驟產(chǎn)物)

    60

    Ligation Enhancer 2.0

    30*

    DNA Adapter

    5**

    Rapid T4 DNA Ligase 2.0

    5

    【注】:*Ligation Enhancer比較粘稠,請上下顛倒、振蕩,充分混勻并瞬時(shí)離心后使用。

    **本公司接頭濃度與常規(guī)商業(yè)化試劑盒一致,Illumina®平臺(tái)皆為15 μM,MGI®平臺(tái)皆為10 μM。

    4. 使用移液器輕輕吹打或振蕩混勻,并短暫離心將反應(yīng)液收集至管底。

    5. PCR管置于PCR儀中,設(shè)置表9所示反應(yīng)程序,進(jìn)行接頭連接反應(yīng):

    9  Adapter Ligation PCR反應(yīng)程序

    溫度

    時(shí)間

    熱蓋

    Off

    20 °C

    15 min

    4 °C

    Hold

    【注】:當(dāng)Input DNA量較低,實(shí)驗(yàn)效果不理想時(shí),可嘗試將連接時(shí)間延長一倍。

     

    3.3 連接產(chǎn)物磁珠純化 (Post-Ligation Clean Up)

    該步驟使用磁珠對(duì)3.2步驟的產(chǎn)物進(jìn)行直接純化或分選。純化可除去未連接的AdapterAdapter Dimer等無效產(chǎn)物。直接純化步驟參考3.3.1,分選步驟參考3.3.23.3.1 純化操作步驟:

    1. 準(zhǔn)備工作:將Hieff NGS® DNA Selection Beads磁珠由冰箱中取出,室溫平衡至少30 min。配制80%乙醇。

    2. 渦旋振蕩或充分顛倒磁珠以保證充分混勻。

    3. 吸取60 μL Hieff NGS® DNA Selection Beads (0.6×,Beads:DNA=0.6:1)Adapter Ligation產(chǎn)物中,渦旋混勻或移液器吹打10次混勻,室溫孵育5 min。

    4. PCR管短暫離心并置于磁力架中分離磁珠和液體,待溶液澄清后(約5 min),小心移除上清。

    5. 保持PCR管始終置于磁力架中,加入200 μL新鮮配制的80%乙醇漂洗磁珠,室溫孵育30 sec后,小心移除上清。

    6. 重復(fù)步驟5,總計(jì)漂洗兩次。

    7. 保持PCR管始終置于磁力架中,開蓋空氣干燥磁珠至剛剛出現(xiàn)龜裂(不超過5 min)。

    8. PCR管從磁力架中取出,進(jìn)行洗脫:

    1)如產(chǎn)物無需進(jìn)行片段分選,直接加入21 μL ddH2O,渦旋振蕩或使用移液器輕輕吹打至充分混勻,室溫靜置5 min。將PCR管短暫離心并置于磁力架中靜置,待溶液澄清后(約5 min),小心移取20 μL上清至新PCR管中,切勿觸碰磁珠。

    【注】:如純化產(chǎn)物如需保存,可使用TE Buffer洗脫。

    2)如產(chǎn)物需進(jìn)行雙輪分選,加入102 μL ddH2O,渦旋振蕩或使用移液器輕輕吹打至充分混勻,室溫靜置5 min。將PCR管短暫離心并置于磁力架中靜置,待溶液澄清后(約5 min),小心移取100 μL上清至新PCR管中,切勿觸碰磁珠。

    【注】:如純化產(chǎn)物如需保存,可使用TE Buffer洗脫。

     

    3.3.2 雙輪分選操作步驟:

    1. 準(zhǔn)備工作:將Hieff NGS® DNA Selection Beads磁珠由冰箱中取出,室溫平衡約30 min。配制80%乙醇。

    2. 請渦旋振蕩或充分顛倒磁珠以保證混勻。

    3. 根據(jù)DNA片段長度要求,參考表10向上述100 μL DNA上清中加入第一輪分選磁珠,渦旋或移液器吹打10次混勻。

    10  磁珠文庫分選推薦比例

    DNA文庫大?。ú迦肫危?/font>

    150 - 250 bp

    200-300 bp

    300-400 bp

    400-500 bp

    DNA文庫大小

    250-350 bp

    350-450 bp

    450-550 bp

    550-650 bp

    第一輪體積比 (Beads:DNA)

    0.80×

    0.70×

    0.60×

    0.55×

    第二輪體積比 (Beads:DNA)

    0.20×

    0.20×

    0.20×

    0.15×

    【注】:表中“×”表示樣品DNA體積。如文庫插入片段長度為250 bp,樣品DNA體積為100 μL,則第一輪分選磁珠使用體積為0.70×100 μL=70 μL;第二輪分選磁珠使用體積為0.20×100 μL=20 μL;表中所推薦比例是針對(duì)于Adapter Ligated Insert DNA (Post Ligation),如果用戶在接頭連接前進(jìn)行分選,請采用Hieff NGS® DNA Selection Beads (Cat#12601)說明書中推薦的比例。

    4. 室溫孵育5 min

    5. PCR管短暫離心并置于磁力架中,待溶液澄清后(約5 min),小心轉(zhuǎn)移上清到干凈的離心管中。

    6. 參考表8向上清中加入第二輪分選磁珠。

    7. 渦旋混勻或移液器吹打10次混勻,室溫靜置5 min。

    8. PCR管短暫離心并置于磁力架中,待溶液澄清后(約5 min),小心移除上清。

    9. 保持PCR管始終處于磁力架中,加入200 μL新鮮配制的80%乙醇漂洗磁珠,室溫孵育30 sec,小心移除上清。

    10. 重復(fù)步驟9。

    11. 保持PCR管始終處于磁力架中,開蓋干燥磁珠至剛剛出現(xiàn)龜裂(約5 min)。

    12. PCR管從磁力架中取出,加入適量21 μL ddH2O,渦旋振蕩或使用移液器輕輕吹打充分混勻,室溫靜置5 min。

    13. PCR管短暫離心并置于磁力架中分離磁珠和液體。待溶液澄清后(約5 min),小心轉(zhuǎn)移20 μL上清至干凈的管中。

     

    3.4 文庫擴(kuò)增 (Library Amplification)

    該步驟將對(duì)純化或長度分選后的接頭連接產(chǎn)物進(jìn)行PCR擴(kuò)增富集。

    1. 將表11中試劑解凍后顛倒混勻,置于冰上備用

    2. 于無菌PCR管中配制表11所示反應(yīng)體系。

    11  PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系

    名稱

    體積 (μL)

    Adapter Ligated DNA3.3步驟產(chǎn)物)

    20

    Canace® Pro Amplification Mix 2.0

    25

    Primer mix

    5

    【注】:*如果使用的是完整接頭(Cat#13519~Cat#13520,使用DNA Library Prep Primer Mix for IlluminaCat#12190試劑盒中的Primer Mix進(jìn)行擴(kuò)增;如果使用的是MGI接頭Cat#13360 ~ Cat#13362),使用DNA Library Prep Primer Mix for MGICat#12191試劑盒中的Primer Mix進(jìn)行擴(kuò)增;如果使用了不完整的接頭Cat#12412~Cat#12413、Cat#12404~Cat#12407,請參照上述試劑盒說明書,使用其中配備的Index Primer進(jìn)行擴(kuò)增。

    3. 使用移液器輕輕吹打或振蕩混勻,并短暫離心將反應(yīng)液收集至管底。

    4. PCR管置于PCR儀中,設(shè)置表12所示反應(yīng)程序,進(jìn)行PCR擴(kuò)增。

    12  PCR擴(kuò)增反應(yīng)程序

    溫度

    時(shí)間

    循環(huán)數(shù)

    98 °C

    1 min

    1

    98 °C

    10 sec

    參照注意事項(xiàng)中表5

    60 °C

    30 sec

    72 °C

    30 sec

    72 °C

    5 min

    1

    4 °C

    Hold

    -


    3.5 擴(kuò)增產(chǎn)物磁珠純化或分選 (Post Amplification Clean Up/Size Selection)

    3.3.1步驟中純化操作步驟。使用Hieff NGS® DNA Selection Beads (0.9×Beads:DNA=0.9:1)純化文庫擴(kuò)增產(chǎn)物。

    如需分選,操作方法同3.3.2雙輪分選步驟(純化步驟可省略)。

     

    3.6 文庫質(zhì)量控制

    通常情況下,構(gòu)建好的文庫可通過濃度檢測和長度分布檢測來進(jìn)行質(zhì)量評(píng)價(jià),具體請參見注意事項(xiàng)六。

     

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