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Hieff NGS? Ultima Pro DNA Library Prep Kit 全能型DNA建庫試劑盒
- 品牌:翌圣生物
- 產(chǎn)地:
- 供應(yīng)商報(bào)價(jià):面議
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翌圣生物科技(上海)股份有限公司
更新時(shí)間:2024-12-24 09:03:45
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銷售范圍售全國
入駐年限第1年
營業(yè)執(zhí)照已審核
- 同類產(chǎn)品DNA建庫試劑(83件)
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聯(lián)系方式:400-611-1883
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詳細(xì)介紹
Hieff NGS® Ultima Pro DNA Library Prep Kit是針對(duì)Illumina®和MGI®高通量測序平臺(tái)專業(yè)開發(fā)設(shè)計(jì)的新一代建庫試劑盒。本產(chǎn)品采用高質(zhì)量的酶學(xué)組成,在前一代建庫試劑盒的基礎(chǔ)上,改進(jìn)了DNA片段末端修復(fù)和加A效率,同時(shí)改善了接頭連接效率。本試劑盒采用新型的高保真酶,顯著提高擴(kuò)增均一性和保真性,可應(yīng)用于常規(guī)動(dòng)植物基因組、微生物基因組、FFPE、cfDNA、ChIP DNA等樣本,助力獲得優(yōu)異的測序數(shù)據(jù)。
產(chǎn)品組分
運(yùn)輸與保存方法
冰袋運(yùn)輸。所有組分-20 °C保存,有效期1年。
注意事項(xiàng)
一、關(guān)于操作
1. 為了您的安全和健康,請穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
2. 請于使用前將試劑盒各組分置于室溫解凍。解凍后上下顛倒數(shù)次充分混勻,短暫離心后置于冰上待用。
3. 配制各步驟反應(yīng)液時(shí)推薦使用移液器吹打混勻或輕輕振蕩,劇烈振蕩可能會(huì)造成文庫產(chǎn)出下降。
4. 為避免樣品交叉污染,推薦使用帶濾芯的槍頭,吸取不同樣品時(shí)請更換槍頭。
5. 推薦在帶熱蓋的PCR儀中進(jìn)行各步驟反應(yīng),使用前應(yīng)預(yù)熱PCR儀至反應(yīng)溫度附近。
6. PCR產(chǎn)物因操作不當(dāng)極容易產(chǎn)生氣溶膠污染,進(jìn)而影響實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確性。推薦將PCR反應(yīng)體系配制區(qū)和PCR產(chǎn)物純化檢測區(qū)進(jìn)行強(qiáng)制性的物理隔離;使用專用的移液器等設(shè)備;并定時(shí)對(duì)各實(shí)驗(yàn)區(qū)域進(jìn)行清潔(使用0.5%次氯酸鈉或10%漂白劑進(jìn)行擦拭清理),以保證實(shí)驗(yàn)環(huán)境的潔凈度。
7. 本產(chǎn)品僅作科研用途!
二、關(guān)于DNA片段化
1. 本試劑盒中兼容機(jī)械法及酶切法片段化的DNA。
2. 本試劑盒兼容范圍為100 pg - 1000 ng Input DNA。應(yīng)盡可能使用A260/A280 = 1.8-2.0的高質(zhì)量Input DNA。表1中列舉了將本試劑盒應(yīng)用于常見應(yīng)用中推薦的Input DNA量。
表1 常見應(yīng)用中推薦Input DNA量
應(yīng)用
樣本類型
推薦Input DNA量
全基因組測序
復(fù)雜基因組
50 ng-1000 ng
靶向捕獲測序
復(fù)雜基因組
10 ng-1000 ng
全基因組測序,靶向捕獲測序
FFPE DNA
50 ng-1000 ng
全基因組測序,靶向捕獲測序
cfDNA/ctDNA
≥500 pg
全基因組測序
微生物基因組
≥1 ng
全基因組測序PCR-free測序
高質(zhì)量DNA
≥50 ng
【注】:上表為使用高質(zhì)量DNA時(shí)推薦的Input DNA量,當(dāng)Input DNA質(zhì)量較差或需要進(jìn)行片段分選時(shí),應(yīng)適當(dāng)上調(diào)使用量。
3. Input DNA特指投入末端修復(fù)/dA尾添加步驟中的DNA。
4. Input DNA制備過程中帶入的高濃度金屬離子螯合劑或其他鹽,可能會(huì)影響末端修復(fù)/dA尾添加步驟反應(yīng)效率,建議DNA片段化后進(jìn)行磁珠純化或分選。當(dāng)使用機(jī)械法進(jìn)行DNA片段化且產(chǎn)物不進(jìn)行純化或長度分選而直接建庫時(shí),請將DNA稀釋在TE Buffer中進(jìn)行片段化,請勿在滅菌超純水中進(jìn)行。
三、關(guān)于接頭連接(Adapter Ligation)
1. 針對(duì)Illumina®測序平臺(tái),Yeasen提供Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 1~Set 2 (Cat#13519~Cat#13520),試劑盒中的接頭濃度為15 μM;Hieff NGS® 384 CDI Primer for Illumina®(Cat#12412~Cat#12413),試劑盒中的接頭濃度為
15 μM;Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina® (Cat#12404~Cat#12407),試劑盒中的接頭濃度為15 μM;Hieff NGS® Dual UMI UDI Adapter Kit for Illumina®,Set1~Set2 (Cat#13370~Cat#13371),試劑盒中的接頭濃度為15 μM。
2.針對(duì)MGI® 高通量測序平臺(tái),Yeasen提供了Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI®,Set 1~Set 3(Cat#13360 ~ Cat#13362),試劑盒中的接頭濃度為10 μM;Hieff NGS® 384 CDI Primer for MGI®,Set 1~Set 2(Cat#13363 ~ Cat#13364),試劑盒中的接頭濃度為10 μM;也可搭配Hieff NGS® Dual UMI UDB Adapter Kit for MGI®,Set 1~Set 2 (Cat#13367~Cat#13368)雙端UMI UDB短接頭,試劑盒中的接頭濃度為10 μM。
3. Adapter的質(zhì)量和使用濃度直接影響連接效率及文庫產(chǎn)量。Adapter用量過高可能會(huì)產(chǎn)生較多Adapter Dimer;用量較低可能會(huì)影響連接效率及文庫產(chǎn)量;使用Adapter時(shí)根據(jù)Input DNA量用TE Buffer進(jìn)行相應(yīng)稀釋。
表2列舉了使用本試劑盒的不同Input DNA量推薦的針對(duì)Illumina®測序平臺(tái)的Adapter稀釋方法。
表3列舉了使用本試劑盒的不同Input DNA量推薦的針對(duì)MGI®測序平臺(tái)的Adapter稀釋方法。
表4列舉了使用本公司Hieff NGS® Dual UMI UDB Adapter Kit for MGI®,Set 1~Set 2 (Cat#13367~Cat#13368)的不同Input DNA量推薦的UMI Adapter稀釋方法。
表2 100 pg-1 μg Input DNA針對(duì)Illumina®測序平臺(tái)推薦的Adapter使用濃度
Input DNA
Adapter稀釋倍數(shù)
濃度
0.1ng ~ 1 ng
150倍稀釋
0.1 μM
1 ng ~ 10 ng
75倍稀釋
0.2 μM
10 ng ~ 25 ng
15倍稀釋
1 μM
25 ng ~ 100 ng
7.5倍稀釋
2 μM
100 ng ~ 1000 ng
3倍稀釋
5 μM
表3 100 pg-1ug Input DNA針對(duì)MGI®測序平臺(tái)推薦的Adapter使用濃度
Input DNA
Adapter稀釋倍數(shù)
濃度
<1 ng
100倍稀釋
0.1 μM
1 ng ~ 10 ng
50倍稀釋
0.2 μM
10 ng ~ 25 ng
10倍稀釋
1 μM
25 ng ~ 100 ng
5倍稀釋
2 μM
100 ng ~ 1000 ng
2倍稀釋
5 μM
表4 100 pg-1ug Input DNA針對(duì)MGI®測序平臺(tái)推薦的UMI Adapter使用濃度
Input DNA
Adapter稀釋倍數(shù)
濃度
5 ng ~ 25 ng
50倍稀釋
0.2 μM
25 ng ~ 100 ng
10倍稀釋
1 μM
100 ng ~ 1000 ng
4倍稀釋
2.5 μM
四、關(guān)于磁珠純化與分選 (Bead-based Clean Up and Size Selection)
1. DNA片段長度分選步驟可選擇在末端修復(fù)/dA尾添加之前,或接頭連接后,或文庫擴(kuò)增后進(jìn)行。
2. 當(dāng)Input DNA質(zhì)量≥50 ng,您可選擇在接頭連接后分選;如Input DNA質(zhì)量<50 ng,建議您在文庫擴(kuò)增后進(jìn)行分選。
3. Ligation Enhancer中包含高濃度的PEG,會(huì)對(duì)雙輪磁珠分選產(chǎn)生顯著影響。因此,如在接頭連接后進(jìn)行長度分選,必須先進(jìn)行純化步驟,再進(jìn)行雙輪分選步驟;如在末端修復(fù)/dA尾添加之前或文庫擴(kuò)增后進(jìn)行長度分選,可直接進(jìn)行雙輪磁珠分選步驟。
4. 磁珠使用前應(yīng)先平衡至室溫,否則會(huì)導(dǎo)致得率下降、分選效果不佳。
5. 磁珠每次使用前都應(yīng)充分振蕩混勻或使用移液器上下吹打充分混勻。
6. 轉(zhuǎn)移上清時(shí),請勿吸取磁珠,即使微量殘留都將影響后續(xù)文庫質(zhì)量。
7. 磁珠漂洗使用的80%乙醇應(yīng)現(xiàn)用現(xiàn)配,否則將影響回收效率。
8. 進(jìn)行長度分選時(shí),初始樣品體積應(yīng)盡量≥100 μL,不足時(shí)請用超純水補(bǔ)齊。以防因樣品體積太小導(dǎo)致移液誤差增大。
9. 產(chǎn)物洗脫前應(yīng)將磁珠置于室溫干燥。干燥不充分容易造成無水乙醇?xì)埩粲绊懞罄m(xù)反應(yīng);過分干燥又會(huì)導(dǎo)致磁珠開裂進(jìn)而降低純化得率。通常情況下,室溫干燥3-5 min足以讓磁珠充分干燥。
10. DNA純化或長度分選產(chǎn)物如需保存,可使用TE Buffer洗脫,產(chǎn)物可于4 °C可保存1-2周,-20 °C可保存1個(gè)月。
五、關(guān)于文庫擴(kuò)增 (Library Amplification)
1. 是否需要進(jìn)行文庫擴(kuò)增取決于Input DNA量、Adapter是否為完整長度、應(yīng)用需要等因素。如使用非完整長度Adapter,必須進(jìn)行這一步驟。如使用完整長度Adapter,當(dāng)Input DNA<200 ng時(shí),推薦進(jìn)行文庫擴(kuò)增;當(dāng)Input DNA≥200 ng或者不需要進(jìn)行文庫擴(kuò)增時(shí),可不進(jìn)行文庫擴(kuò)增。
2. 文庫擴(kuò)增步驟需要嚴(yán)格控制擴(kuò)增循環(huán)數(shù)。循環(huán)數(shù)不足,將導(dǎo)致文庫產(chǎn)量低;循環(huán)數(shù)過多,又將導(dǎo)致文庫偏好性增加、重復(fù)度增加、嵌合產(chǎn)物增加、擴(kuò)增突變積累等多種不良后果。表5列舉了使用本試劑盒,獲得1 μg文庫的推薦循環(huán)數(shù)。
表5 100 pg-1000 ng Input DNA獲得1 μg產(chǎn)物擴(kuò)增循環(huán)數(shù)推薦表
Input DNA
1 μg文庫產(chǎn)量推薦PCR循環(huán)數(shù)
1000 ng
2 - 4
500 ng
2 - 4
250 ng
4 - 6
100 ng
5 - 7
50 ng
7 - 9
10 ng
9 - 11
5 ng
10 - 12
1 ng
12 - 15
100 pg
16 - 18
【注】:
1.表5為使用200 bp左右的高質(zhì)量Input DNA測試的循環(huán)數(shù)參數(shù)。FFPE DNA質(zhì)量差異較大,當(dāng)DNA質(zhì)量較差或文庫長度較長時(shí),需適當(dāng)提高循環(huán)數(shù)以獲取足量文庫。
2.如果建庫過程中需要進(jìn)行過片段分選,推薦較高循環(huán)數(shù)進(jìn)行Library Amplification;反之則參照較低循環(huán)數(shù)即可。
3.如果使用了不完整的接頭,需要擴(kuò)增至少2個(gè)循環(huán),形成完整的接頭。
六、關(guān)文庫質(zhì)檢 (Library Quality Analysis)
1. 通常情況下,構(gòu)建好的文庫可通過長度分布檢測和濃度檢測來進(jìn)行質(zhì)量評(píng)價(jià)。
2. 文庫濃度檢測可使用:基于雙鏈DNA熒光染料的方法,如Qubit®、PicoGreen®等;基于qPCR絕對(duì)定量的方法。
3. 文庫濃度檢測不可使用:基于光譜檢測的方法,如NanoDrop®等。
4. 推薦使用qPCR方法進(jìn)行文庫濃度檢測:Qubit®、PicoGreen®等基于雙鏈DNA熒光染料的濃度測定方法時(shí),無法有效區(qū)分單端連接Adapter的產(chǎn)物、兩端均未連接Adapter的產(chǎn)物以及其他不完整雙鏈結(jié)構(gòu)產(chǎn)物;qPCR絕對(duì)定量基于PCR擴(kuò)增原理,僅定量樣品中兩端Adapter完整的文庫(即可測序的文庫),可排除單端或雙端都不連接Adapter的不可測序文庫的干擾。
5. 文庫長度分布檢測,可通過Agilent Bioanalyzer 2100等基于毛細(xì)管電泳或微控流原理的設(shè)備進(jìn)行檢測。
使用方法
一、自備材料
1. 純化磁珠:Cat#12601,Hieff NGS® DNA Selection Beads或Cat#A63880,AMPure XP Beads或其他等效產(chǎn)品。
2. DNA質(zhì)控:Agilent Technologies 2100 Bioanalyzer或其他等效產(chǎn)品。
3. DNA Adapter:可選Yeasen 官網(wǎng)的Hieff NGS® Complete Adapter Kit for Illumina®, Set 1~Set 2 (Cat#13519~Cat#13520);雙端384種CDI Primers:Hieff NGS® 384 CDI Primer for Illumina®, Set 1~Set 2 (Cat#12412~Cat#12413);雙端384種UDI Primers:Hieff NGS® Stubby UDI Primer Kit for Illumina® (Cat#12404~Cat#12407),Hieff NGS® Dual UMI UDI Adapter Kit for Illumina®,Set1~Set2 (Cat#13370~Cat#13371)DNA 文庫構(gòu)建專用配套試劑盒,
或者可選匹配MGI平臺(tái)的接頭:Hieff NGS® Complete Adapter Kit for MGI®,Set 1~Set 3(Cat#13360 ~ Cat#13362);Hieff NGS® 384 CDI Primer for MGI®,Set 1~Set 2(Cat#13363 ~ Cat#13364);Hieff NGS® Dual UMI UDB Adapter Kit for MGI®,Set 1~Set 2 (Cat#13367~Cat#13368);接頭詳細(xì)介紹信息參考上面注意事項(xiàng)中的第三部分“關(guān)于接頭連接”。
4.DNA Primer Mix:Cat#12190,DNA Library Prep Primer Mix for Illumina® 或Cat#12191,DNA Library Prep Primer Mix for MGI®
5. 其他材料:無水乙醇、滅菌超純水、TE Buffer (10 mM Tris-HCl,pH 8.0-8.5+1 mM EDTA)、低吸附EP管、PCR管、磁力架、PCR儀等。
二、操作流程圖1 Hieff NGS® Ultima Pro DNA Library Prep Kit for Illumina操作流程
三、操作步驟
3.1 末端修復(fù)/dA尾添加 (End Repair/dA-Taling)
該步驟將片段化后的Input DNA末端補(bǔ)平,并進(jìn)行5’端磷酸化和3’端加dA尾。
1. 將表6中各試劑解凍后,顛倒混勻,置于冰上備用。
2. 于無菌PCR管中配制表6所示反應(yīng)體系。
表6 末端修復(fù)/dA尾添加PCR反應(yīng)體系
名稱
體積 (μL)
Fragmented DNA
x
Endprep Buffer 2.0
6
Endprep Enzyme 2.0
4
ddH2O
Up to 60
3. 使用移液器輕輕吹打或振蕩混勻,并短暫離心將反應(yīng)液離心至管底。
4. 將上述PCR管置于PCR儀,設(shè)置表7所示反應(yīng)程序,進(jìn)行末端修復(fù)/dA尾添加反應(yīng)。
表7 末端修復(fù)/dA尾添加PCR反應(yīng)程序
溫度
時(shí)間
熱蓋105 °C
On
30 °C
20 min
72 °C
20 min
4 °C
Hold
3.2 接頭連接 (Adapter Ligation)
該步驟將3.1步驟的產(chǎn)物末端,連接特定的Illumina®接頭。
1. 根據(jù)Input DNA量按表2-4稀釋Adapter至合適濃度。
2. 將表8中各試劑解凍后顛倒混勻,置于冰上備用。
3. 于3.1步驟PCR管中配制表8所示反應(yīng)體系。
表8 Adapter Ligation PCR體系
名稱
體積 (μL)
dA-tailed DNA(3.1步驟產(chǎn)物)
60
Ligation Enhancer 2.0
30*
DNA Adapter
5**
Rapid T4 DNA Ligase 2.0
5
【注】:*Ligation Enhancer比較粘稠,請上下顛倒、振蕩,充分混勻并瞬時(shí)離心后使用。
**本公司接頭濃度與常規(guī)商業(yè)化試劑盒一致,Illumina®平臺(tái)皆為15 μM,MGI®平臺(tái)皆為10 μM。
4. 使用移液器輕輕吹打或振蕩混勻,并短暫離心將反應(yīng)液收集至管底。
5. 將PCR管置于PCR儀中,設(shè)置表9所示反應(yīng)程序,進(jìn)行接頭連接反應(yīng):
表9 Adapter Ligation PCR反應(yīng)程序
溫度
時(shí)間
熱蓋
Off
20 °C
15 min
4 °C
Hold
【注】:當(dāng)Input DNA量較低,實(shí)驗(yàn)效果不理想時(shí),可嘗試將連接時(shí)間延長一倍。
3.3 連接產(chǎn)物磁珠純化 (Post-Ligation Clean Up)
該步驟使用磁珠對(duì)3.2步驟的產(chǎn)物進(jìn)行直接純化或分選。純化可除去未連接的Adapter或Adapter Dimer等無效產(chǎn)物。直接純化步驟參考3.3.1,分選步驟參考3.3.2。3.3.1 純化操作步驟:
1. 準(zhǔn)備工作:將Hieff NGS® DNA Selection Beads磁珠由冰箱中取出,室溫平衡至少30 min。配制80%乙醇。
2. 渦旋振蕩或充分顛倒磁珠以保證充分混勻。
3. 吸取60 μL Hieff NGS® DNA Selection Beads (0.6×,Beads:DNA=0.6:1)至Adapter Ligation產(chǎn)物中,渦旋混勻或移液器吹打10次混勻,室溫孵育5 min。
4. 將PCR管短暫離心并置于磁力架中分離磁珠和液體,待溶液澄清后(約5 min),小心移除上清。
5. 保持PCR管始終置于磁力架中,加入200 μL新鮮配制的80%乙醇漂洗磁珠,室溫孵育30 sec后,小心移除上清。
6. 重復(fù)步驟5,總計(jì)漂洗兩次。
7. 保持PCR管始終置于磁力架中,開蓋空氣干燥磁珠至剛剛出現(xiàn)龜裂(不超過5 min)。
8. 將PCR管從磁力架中取出,進(jìn)行洗脫:
1)如產(chǎn)物無需進(jìn)行片段分選,直接加入21 μL ddH2O,渦旋振蕩或使用移液器輕輕吹打至充分混勻,室溫靜置5 min。將PCR管短暫離心并置于磁力架中靜置,待溶液澄清后(約5 min),小心移取20 μL上清至新PCR管中,切勿觸碰磁珠。
【注】:如純化產(chǎn)物如需保存,可使用TE Buffer洗脫。
2)如產(chǎn)物需進(jìn)行雙輪分選,加入102 μL ddH2O,渦旋振蕩或使用移液器輕輕吹打至充分混勻,室溫靜置5 min。將PCR管短暫離心并置于磁力架中靜置,待溶液澄清后(約5 min),小心移取100 μL上清至新PCR管中,切勿觸碰磁珠。
【注】:如純化產(chǎn)物如需保存,可使用TE Buffer洗脫。
3.3.2 雙輪分選操作步驟:
1. 準(zhǔn)備工作:將Hieff NGS® DNA Selection Beads磁珠由冰箱中取出,室溫平衡約30 min。配制80%乙醇。
2. 請渦旋振蕩或充分顛倒磁珠以保證混勻。
3. 根據(jù)DNA片段長度要求,參考表10向上述100 μL DNA上清中加入第一輪分選磁珠,渦旋或移液器吹打10次混勻。
表10 磁珠文庫分選推薦比例
DNA文庫大?。ú迦肫危?/font>
150 - 250 bp
200-300 bp
300-400 bp
400-500 bp
DNA文庫大小
250-350 bp
350-450 bp
450-550 bp
550-650 bp
第一輪體積比 (Beads:DNA)
0.80×
0.70×
0.60×
0.55×
第二輪體積比 (Beads:DNA)
0.20×
0.20×
0.20×
0.15×
【注】:表中“×”表示樣品DNA體積。如文庫插入片段長度為250 bp,樣品DNA體積為100 μL,則第一輪分選磁珠使用體積為0.70×100 μL=70 μL;第二輪分選磁珠使用體積為0.20×100 μL=20 μL;表中所推薦比例是針對(duì)于Adapter Ligated Insert DNA (Post Ligation),如果用戶在接頭連接前進(jìn)行分選,請采用Hieff NGS® DNA Selection Beads (Cat#12601)說明書中推薦的比例。
4. 室溫孵育5 min。
5. 將PCR管短暫離心并置于磁力架中,待溶液澄清后(約5 min),小心轉(zhuǎn)移上清到干凈的離心管中。
6. 參考表8向上清中加入第二輪分選磁珠。
7. 渦旋混勻或移液器吹打10次混勻,室溫靜置5 min。
8. 將PCR管短暫離心并置于磁力架中,待溶液澄清后(約5 min),小心移除上清。
9. 保持PCR管始終處于磁力架中,加入200 μL新鮮配制的80%乙醇漂洗磁珠,室溫孵育30 sec,小心移除上清。
10. 重復(fù)步驟9。
11. 保持PCR管始終處于磁力架中,開蓋干燥磁珠至剛剛出現(xiàn)龜裂(約5 min)。
12. 將PCR管從磁力架中取出,加入適量21 μL ddH2O,渦旋振蕩或使用移液器輕輕吹打充分混勻,室溫靜置5 min。
13. 將PCR管短暫離心并置于磁力架中分離磁珠和液體。待溶液澄清后(約5 min),小心轉(zhuǎn)移20 μL上清至干凈的管中。
3.4 文庫擴(kuò)增 (Library Amplification)
該步驟將對(duì)純化或長度分選后的接頭連接產(chǎn)物進(jìn)行PCR擴(kuò)增富集。
1. 將表11中試劑解凍后顛倒混勻,置于冰上備用。
2. 于無菌PCR管中配制表11所示反應(yīng)體系。
表11 PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系
名稱
體積 (μL)
Adapter Ligated DNA(3.3步驟產(chǎn)物)
20
Canace® Pro Amplification Mix 2.0
25
Primer mix
5
【注】:*如果使用的是完整接頭(Cat#13519~Cat#13520),使用DNA Library Prep Primer Mix for Illumina(Cat#12190)試劑盒中的Primer Mix進(jìn)行擴(kuò)增;如果使用的是MGI接頭(Cat#13360 ~ Cat#13362),使用DNA Library Prep Primer Mix for MGI(Cat#12191)試劑盒中的Primer Mix進(jìn)行擴(kuò)增;如果使用了不完整的接頭(Cat#12412~Cat#12413、Cat#12404~Cat#12407),請參照上述試劑盒說明書,使用其中配備的Index Primer進(jìn)行擴(kuò)增。
3. 使用移液器輕輕吹打或振蕩混勻,并短暫離心將反應(yīng)液收集至管底。
4. 將PCR管置于PCR儀中,設(shè)置表12所示反應(yīng)程序,進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
表12 PCR擴(kuò)增反應(yīng)程序
溫度
時(shí)間
循環(huán)數(shù)
98 °C
1 min
1
98 °C
10 sec
參照注意事項(xiàng)中表5
60 °C
30 sec
72 °C
30 sec
72 °C
5 min
1
4 °C
Hold
-
3.5 擴(kuò)增產(chǎn)物磁珠純化或分選 (Post Amplification Clean Up/Size Selection)同3.3.1步驟中純化操作步驟。使用Hieff NGS® DNA Selection Beads (0.9×,Beads:DNA=0.9:1)純化文庫擴(kuò)增產(chǎn)物。
如需分選,操作方法同3.3.2雙輪分選步驟(純化步驟可省略)。
3.6 文庫質(zhì)量控制
通常情況下,構(gòu)建好的文庫可通過濃度檢測和長度分布檢測來進(jìn)行質(zhì)量評(píng)價(jià),具體請參見注意事項(xiàng)六。
HB20221205
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